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双序列密码子比对工具
双序列密码子比对工具能够用最优化的方式比对两个序列。比对所用的打分矩阵来自于Schneider et al. (2005)。此双序列密码子比对工具用于查找保守编码区。只允许ACGTU作为合法碱基字符。
输入原始序列或者FASTA格式序列，长度限定在6000以内。
>sequence one atgtttcagaaagaggatcttgctacatggatgcaaatttcaatgagtggtcaatttgatgatacagcattagaggaatggagtacaaatggtaaagaacctgagatctgtgagaaatctccaaaagctgatggagttactacgattatggagagagctctatgtccatgggatagcagagtcaactaccaagagagccgagaacctaaattgattgctgaatcagtttgtctatgccgtaagagccgtggttctacaggagctttctgtatgccaattgttcgaaaagttccaattctccgacgtgtctcttgtgatcgttcaacaggtttatggaattatgtaagatcaactgagctaataactgttggatgtcattctgtattgccaagaactcaaagagcagcacgtcttgcccatttatcatcttctcgtattattgtttaa
输入原始序列或者FASTA格式序列，长度限定在6000以内。
>sequence two caggttacaattggagccatttcatcttctgactgaggaaatcaggtccgacagcgtagatgtatacacgctctattcacaaaattggtaacgattctg
配置打分规则
*序列前有跳配（Gap）得
6
5
4
3
2
1
0
-1
-2
-3
-4
-5
-6
*序列中间有跳配（Gap）得
6
5
4
3
2
1
0
-1
-2
-3
-4
-5
-6
*序列后有跳配（Gap）得
6
5
4
3
2
1
0
-1
-2
-3
-4
-5
-6
分
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